Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFI35P80217 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFI35P80217 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFI35P80217 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFI35P80217 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFI35P80217 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFI35P80217 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFI35P80217 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFI35P80217 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFI35P80217 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFI35P80217 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFI35P80217 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFI35P80217 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFI35P80217 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFI35P80217 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFI35P80217 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFI35P80217 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFI35P80217 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFI35P80217 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFI35P80217 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFI35P80217 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFI35P80217 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFI35P80217 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFI35P80217 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFI35P80217 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFI35P80217 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFI35P80217 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFI35P80217 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFI35P80217 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IFI35P80217 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFI35P80217 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFI35P80217 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFI35P80217 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFI35P80217 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFI35P80217 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFI35P80217 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFI35P80217 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFI35P80217 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFI35P80217 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms