Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2P78314 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms