Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTA1P68133 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTA1P68133 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA1P68133 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms