Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P68104 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms