Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS28P62857 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS28P62857 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS28P62857 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS28P62857 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS28P62857 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS28P62857 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS28P62857 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPS28P62857 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPS28P62857 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPS28P62857 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS28P62857 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS28P62857 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS28P62857 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPS28P62857 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS28P62857 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS28P62857 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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