Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARF6P62330 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARF6P62330 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARF6P62330 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARF6P62330 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARF6P62330 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARF6P62330 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARF6P62330 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARF6P62330 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARF6P62330 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARF6P62330 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARF6P62330 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARF6P62330 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARF6P62330 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARF6P62330 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARF6P62330 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARF6P62330 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF6P62330 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF6P62330 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF6P62330 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF6P62330 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF6P62330 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF6P62330 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms