Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC1P62191 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMC1P62191 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC1P62191 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC1P62191 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms