Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1S1P61966 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S1P61966 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms