Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V0D1P61421 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V0D1P61421 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms