Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms