Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP25P60880 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP25P60880 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms