Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4A1P60842 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EIF4A1P60842 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms