Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTBP60709 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTBP60709 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTBP60709 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTBP60709 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTBP60709 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTBP60709 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTBP60709 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTBP60709 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTBP60709 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ACTBP60709 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms