Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00313P59037 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms