Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms