Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBX4P57082 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBX4P57082 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX4P57082 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TBX4P57082 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TBX4P57082 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TBX4P57082 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX4P57082 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX4P57082 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX4P57082 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX4P57082 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX4P57082 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX4P57082 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX4P57082 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX4P57082 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX4P57082 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBX4P57082 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBX4P57082 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBX4P57082 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TBX4P57082 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX4P57082 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX4P57082 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX4P57082 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX4P57082 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX4P57082 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX4P57082 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX4P57082 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX4P57082 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX4P57082 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX4P57082 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms