Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RIPK4P57078 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RIPK4P57078 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms