Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX9P55771 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX9P55771 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX9P55771 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX9P55771 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX9P55771 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX9P55771 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX9P55771 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX9P55771 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX9P55771 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX9P55771 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX9P55771 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX9P55771 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX9P55771 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX9P55771 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX9P55771 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms