Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRPF1P55201 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms