Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLTPP55058 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLTPP55058 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLTPP55058 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLTPP55058 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLTPP55058 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLTPP55058 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLTPP55058 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLTPP55058 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLTPP55058 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLTPP55058 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLTPP55058 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLTPP55058 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLTPP55058 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLTPP55058 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLTPP55058 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLTPP55058 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLTPP55058 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLTPP55058 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLTPP55058 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLTPP55058 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLTPP55058 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLTPP55058 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLTPP55058 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLTPP55058 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLTPP55058 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLTPP55058 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLTPP55058 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLTPP55058 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLTPP55058 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLTPP55058 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLTPP55058 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLTPP55058 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLTPP55058 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLTPP55058 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLTPP55058 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLTPP55058 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms