Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN1P54253 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN1P54253 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms