Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CRISP3P54108 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms