Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLNS1AP54105 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLNS1AP54105 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms