Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPAP53621 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPAP53621 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPAP53621 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPAP53621 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPAP53621 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPAP53621 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPAP53621 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPAP53621 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPAP53621 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COPAP53621 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPAP53621 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPAP53621 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COPAP53621 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COPAP53621 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPAP53621 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPAP53621 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPAP53621 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPAP53621 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPAP53621 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPAP53621 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPAP53621 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPAP53621 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPAP53621 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPAP53621 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPAP53621 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
COPAP53621 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms