Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACLYP53396 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACLYP53396 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACLYP53396 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACLYP53396 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACLYP53396 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACLYP53396 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACLYP53396 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACLYP53396 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACLYP53396 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACLYP53396 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACLYP53396 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACLYP53396 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACLYP53396 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACLYP53396 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACLYP53396 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACLYP53396 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACLYP53396 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACLYP53396 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACLYP53396 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACLYP53396 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACLYP53396 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms