Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAMP7P51809 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAMP7P51809 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms