Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D1P51668 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms