Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLCSP50747 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLCSP50747 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLCSP50747 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLCSP50747 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLCSP50747 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLCSP50747 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLCSP50747 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLCSP50747 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLCSP50747 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLCSP50747 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLCSP50747 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLCSP50747 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HLCSP50747 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLCSP50747 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLCSP50747 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLCSP50747 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLCSP50747 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLCSP50747 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLCSP50747 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLCSP50747 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLCSP50747 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLCSP50747 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLCSP50747 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLCSP50747 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLCSP50747 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLCSP50747 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLCSP50747 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLCSP50747 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms