Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRE11P49959 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRE11P49959 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRE11P49959 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRE11P49959 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRE11P49959 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRE11P49959 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MRE11P49959 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRE11P49959 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRE11P49959 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRE11P49959 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRE11P49959 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MRE11P49959 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRE11P49959 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRE11P49959 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MRE11P49959 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRE11P49959 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRE11P49959 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MRE11P49959 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRE11P49959 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRE11P49959 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRE11P49959 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRE11P49959 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRE11P49959 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRE11P49959 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRE11P49959 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRE11P49959 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRE11P49959 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRE11P49959 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRE11P49959 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MRE11P49959 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRE11P49959 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRE11P49959 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRE11P49959 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRE11P49959 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRE11P49959 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRE11P49959 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRE11P49959 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms