Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms