Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDO2P48775 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDO2P48775 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDO2P48775 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDO2P48775 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDO2P48775 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDO2P48775 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDO2P48775 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDO2P48775 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDO2P48775 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDO2P48775 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TDO2P48775 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDO2P48775 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDO2P48775 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDO2P48775 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDO2P48775 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDO2P48775 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TDO2P48775 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDO2P48775 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDO2P48775 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDO2P48775 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDO2P48775 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDO2P48775 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDO2P48775 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TDO2P48775 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TDO2P48775 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDO2P48775 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TDO2P48775 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDO2P48775 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDO2P48775 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDO2P48775 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDO2P48775 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDO2P48775 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDO2P48775 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDO2P48775 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDO2P48775 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms