Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1DP48730 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1DP48730 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms