Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMUP48645 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMUP48645 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMUP48645 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMUP48645 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMUP48645 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMUP48645 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMUP48645 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMUP48645 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMUP48645 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMUP48645 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMUP48645 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMUP48645 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMUP48645 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMUP48645 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMUP48645 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMUP48645 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMUP48645 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMUP48645 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms