Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPDA1P46926 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms