Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPL28P46779 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL28P46779 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL28P46779 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPL28P46779 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPL28P46779 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms