Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACADSBP45954 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACADSBP45954 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACADSBP45954 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms