Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGEA1P43355 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms