Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDF5P43026 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDF5P43026 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF5P43026 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF5P43026 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF5P43026 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDF5P43026 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF5P43026 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF5P43026 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF5P43026 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF5P43026 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF5P43026 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF5P43026 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF5P43026 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF5P43026 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF5P43026 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF5P43026 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF5P43026 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF5P43026 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF5P43026 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF5P43026 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF5P43026 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF5P43026 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms