Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA2P42262 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms