Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR1BP42025 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1BP42025 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms