Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms