Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM3P40198 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM3P40198 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms