Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IGHMBP2P38935 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms