Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF1P36956 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms