Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL4P36578 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL4P36578 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL4P36578 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL4P36578 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL4P36578 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL4P36578 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL4P36578 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL4P36578 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL4P36578 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL4P36578 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL4P36578 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL4P36578 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL4P36578 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL4P36578 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL4P36578 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL4P36578 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL4P36578 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL4P36578 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL4P36578 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL4P36578 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL4P36578 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms