Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYLC1P35663 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms