Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COPB2P35606 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPB2P35606 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPB2P35606 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPB2P35606 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPB2P35606 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPB2P35606 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPB2P35606 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPB2P35606 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPB2P35606 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPB2P35606 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPB2P35606 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COPB2P35606 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPB2P35606 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPB2P35606 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPB2P35606 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPB2P35606 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPB2P35606 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPB2P35606 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPB2P35606 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPB2P35606 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPB2P35606 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPB2P35606 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPB2P35606 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPB2P35606 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPB2P35606 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COPB2P35606 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPB2P35606 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPB2P35606 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPB2P35606 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPB2P35606 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPB2P35606 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPB2P35606 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPB2P35606 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPB2P35606 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPB2P35606 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COPB2P35606 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COPB2P35606 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPB2P35606 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms