Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD13P35453 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms