Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCD1P33897 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCD1P33897 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCD1P33897 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms