Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL9P32969 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL9P32969 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL9P32969 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL9P32969 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL9P32969 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL9P32969 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL9P32969 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL9P32969 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL9P32969 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL9P32969 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL9P32969 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL9P32969 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL9P32969 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL9P32969 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL9P32969 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL9P32969 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL9P32969 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL9P32969 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL9P32969 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL9P32969 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL9P32969 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL9P32969 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL9P32969 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL9P32969 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL9P32969 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL9P32969 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL9P32969 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL9P32969 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL9P32969 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL9P32969 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL9P32969 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL9P32969 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL9P32969 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL9P32969 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL9P32969 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL9P32969 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL9P32969 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL9P32969 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL9P32969 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL9P32969 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL9P32969 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL9P32969 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL9P32969 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL9P32969 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL9P32969 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL9P32969 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms